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| Home Dipartimento | Software | Centro di Calcolo Didattico della Facoltà di Scienze | ||
| Presentazione | Corsi | |||
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| La ricerca nel campo biomedico e biomolecolare sta producendo in quest'ultimo decennio un'immensa mole di risultati alcuni dei quali, come il progetto genoma e altri progetti su larga scala, stanno producendo dati che non sono pubblicati nella letteratura tradizionale, ma che vengono inseriti in banche dati che stanno raddoppiando il loro contenuto in meno di un anno. Allo stesso tempo il progresso registrato nella procedura di cristallizazione di macromolecole proteiche, nonché la disponibilità di sorgenti di raggi X sempre più intense, sta rapidamente aumentando la banca dati delle strutture tridimensionali, che si sta arricchendo ad una velocità maggiore di una struttura al giorno. Questa larga mole di dati può essere razionalmente consultata unicamente utilizzando mezzi informatici che fino a poco tempo fa non facevano parte del bagaglio culturale del Biologo. A tal fine presso il Centro di Calcolo Didattico della Facoltà di Scienze sono state allestite delle aule didattiche presso le quali è possibile utilizzare, durante lo svolgimento di alcuni insegnamenti del corso di laurea in Scienze Biologiche, una serie di programmi mirati alla manipolazione di strutture mono e tridimensionali | Chimica biologica 2 (Prof.Alessandro Desideri) Gli studenti verranno preparati all'utilizzo di semplici programmi di grafica molecolare allo scopo di poter visualizzare e manipolare strutture tridimensionali di proteine. Laboratorio di Metodologie genetiche (Dott.ssa Manuela Helmer Citterich) Utilizzo del calcolatore per la Biologia. Alcuni argomenti trattati: analisi di sequenze di acidi nucleici, analisi di sequenze di proteine, banche dati di sequenze, marcatori e bibliografiche; cenni di grafica molecolare e "modelling"; uso delle reti (posta elettronica, trasferimento dati, Internet). |
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| Software | ||||
| PDB Protein-Data-Bank Il PDB è un archivio di strutture tridimensionali di macromolecole biologiche determinate sperimentalmente RasMol Permette di visualizzare strutture tridimensionali di macromolecole proteiche memorizzate nella Banca dati PDB (Protein Data Bank) Kinemage Un programma didattico che contiene file di descrizioni di particolari strutturali di macromolecole proteiche. In particolare prevede un percorso didattico su caratteristiche strutturali funzionali di alcune proteine modello. Wisconsin Package ver. 9.1 e SeqWeb ver 1.0 Permette la comparazione di sequenze di macromolecole proteiche e di acidi nucleici. |
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